Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
THY1P04216 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
THY1P04216 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
THY1P04216 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THY1P04216 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THY1P04216 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THY1P04216 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
THY1P04216 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THY1P04216 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
THY1P04216 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THY1P04216 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
THY1P04216 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THY1P04216 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THY1P04216 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THY1P04216 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THY1P04216 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms