Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POP4O95707 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POP4O95707 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POP4O95707 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POP4O95707 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms