Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABARAPO95166 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms