Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIA3O75145 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms