Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POTEMA6NI47 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms