Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNPO3Q9Y5L0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TNPO3Q9Y5L0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms