Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
RAD54L2Q9Y4B4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms