Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms