Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF18Q9UNG2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TNFSF18Q9UNG2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms