Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MRTO4Q9UKD2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms