Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms