Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL9Q9P2J3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms