Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRBP1Q9P2E9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms