Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EHD3Q9NZN3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EHD3Q9NZN3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms