Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CHCHD3Q9NX63 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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