Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms