Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL11Q9NVR0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms