Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTG1Q9NSN8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms