Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RASSF1Q9NS23 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms