Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms