Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBQLN4Q9NRR5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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