Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRHQ9HD43 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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