Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms