Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNG6Q9BXT2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms