Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NUP58Q9BVL2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms