Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDLIM2Q96JY6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms