Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRIG1Q96JA1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms