Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FRAT1Q92837 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms