Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRUQ92729 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
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