Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CTTNBP2Q8WZ74 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms