Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC107Q8WV48 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC107Q8WV48 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms