Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HELBQ8NG08 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms