Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC83Q8IWF9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC83Q8IWF9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms