Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD2

ERC1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERC1Q8IUD2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERC1Q8IUD2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms