Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC51AQ86UW1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC51AQ86UW1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms