Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPOCD1Q6ZMY3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms