Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL35Q6PF15 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms