Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNP1Q6NT89 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRNP1Q6NT89 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms