Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARMC3Q5W041 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms