Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms