Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARFGEF3Q5TH69 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms