Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATAD3CQ5T2N8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms