Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms