Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCGF3Q3KNV8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCGF3Q3KNV8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms