Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCK2Q16822 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms