Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDSNQ15517 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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