Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKRD1Q15327 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKRD1Q15327 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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