Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NBR1Q14596 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NBR1Q14596 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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