Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE1CQ14123 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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