Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCARB2Q14108 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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